Il Dipartimento nasce nell'anno accademico 1994-95 dall'accorpamento degli Istituti di Farmacologia e di Microbiologia della Facoltà di Medicina e Chirurgia, e di Farmacologia e Farmacognosia della Facoltà di Farmacia. Nel Dipartimento si studiano le ricadute farmacologiche del rapporto ospite tumore nei malati, e si valutano su animali i protocolli chemioterapici: ad esempio, l'attività antitumorale e antimetastatica di complessi di metalli sui tumori umani e nei roditori. Oltre alle ricerche di farmaci antitumorali, nel Dipartimento si studiano, tra l'altro, i modelli d'ansia e gli effetti ansiolitici di alcuni farmaci anticonvulsivi, e l'epidemiologia delle infezioni trasmesse da zecche.